Våra gröna vänner Donatello, Leonardo, Michelangelo och Rafael är tillbaka! Sist vi såg dem hade de besegrat sin ärkenemesis Shredder. Nu när vi träffar dem igen har de glidit ifrån varandra. Men när hela staden New Yorks existens hotas av en armé av uråldriga monster under ledning av en galen industriman måste Turtles ninjamästare Splinter förena den gröna kvartetten igen.

Mästerpiloten Porco Rosso har genom en förbannelse förvandlats till en gris. När han utmanas av den hetlevrade amerikanen Curtis måste han, med hjälp av den unge Fio, få sitt slitna plan tillbaka i dugligt skick. Samtidigt försöker Porco Rosso vinna tillbaka sin älskades hjärta.

Efter en viktig seger på Christophsis får Anakin och hans nya padawan Ahsoka Tano uppdraget att rädda Jabba the Hutts son. Politiska intriger gör deras uppdrag svårare än förutspått.
Filmen utspelar sig efter Episod II.