The Spirit Molecule undersöker dimethyltryptamine (DMT), en naturligt förekommande förening, som existerar i människor och många andra arter av djur och växter. Dokumentären följer Dr. Rick Strassman regerings finansierade DMT experiment på människor och dess många utmaningar , motgångar och otänkbara upptäckter. En närmare undersökning av DMT’s effekter genom linsen på två tidigare motsättningar, vetenskap och andlighet, The Spirit Molecule utforskar sambanden mellan neurologi, kvantfysik och mänsklig andlighet. Strassman’s forskning och upplevelserna från dem mänskliga försökskaninerna före, efter och under dem intensiva experimenten väcker många intressanta frågor. En respektabel skara av experter berättar sina unika tankar och erfarenheter av DMT inom sina egna områden. Allt medans Strassmans berättelse presenteras stärker dessa experter hans anmärkningsvärda teorier.